Peter Parker (Maguire), kan ikke få sit liv til at fungere, når han både skal passe sin uddannelse og samtidig betale sin husleje, og redde verden forklædt som Spider-man. Så han beslutter at kvitte superhelte gerningen, så han måske også har en chance hos Mary Jane (Dunst). Han bliver gode venner med Dr. Otto Octavius, som er på nippet til at vise en billigere, renere form for energi, men under demonstrationen af projektet går det helt galt og Dr. Octavius mister sin kone, samtidig med at han har fire computer styrede arme sat fast på kroppen… Besat af at få sit projekt til at fungere, går Dr.Octavius helt amok, og kun én mand kan stoppe ham! Nemlig Spider-man…